行業(yè)動(dòng)態(tài)
COVID-19檢測小貼士
為了支持新型冠狀病毒(COVID-19)的檢測及疫苗研發(fā)工作,美國疾病預防控制中心(CDC)和中國政府都已完成了新型冠狀病毒基因組的測序并將結果提交至US NCBI GenBank®數據庫 [1]。近日,IDT收到了來(lái)自世界各地研究人員關(guān)于新型冠狀病毒檢測試劑盒的詢(xún)問(wèn),以下是部分簡(jiǎn)要說(shuō)明。
美國疾病預防控制中心
美國疾病預防控制中心檢測試劑盒* 靶向COVID-19核衣殼蛋白基因(N-基因)上的不同位點(diǎn)。該試劑盒中的3組引物/探針必須與靶向人RNase P基因的內部對照同時(shí)運行。每個(gè)患者樣本共需進(jìn)行4次qPCR檢測。
1.該檢測試劑盒采用一步法qPCR反應(即逆轉錄和后續qPCR反應在同一步驟中完成);
2.所有3次N-基因檢測只有在Cq <35時(shí)方可視為陽(yáng)性結果;
3.RNase P內部對照反應是關(guān)鍵。Cq >35表示樣本提取不佳,需要重復實(shí)驗;
敬請查閱最新的美國疾病預防控制中心 COVID-19 RT-PCR檢測方法實(shí)驗室指南,獲取相關(guān)文檔及實(shí)驗方案。
與其他檢測試劑盒的比較
世界衛生組織(WHO)
世界衛生組織實(shí)驗方案不同于美國疾病預防控制中心實(shí)驗方案。世界衛生組織建議需進(jìn)行3次qPCR反應來(lái)確認是否感染COVID-19。盡管這是一套完整的實(shí)驗方案,但沒(méi)有美國疾病預防控制中心檢測方法來(lái)得快,因為它需要連續進(jìn)行3次檢測,且必須觀(guān)察到陽(yáng)性結果才能進(jìn)行下一次檢測。該實(shí)驗方案按如下順序進(jìn)行檢測:
1.冠狀病毒E-基因
2.RdRP基因:針對SARS 冠狀病毒和其他蝙蝠相關(guān)冠狀病毒
3.RdRP基因:針對COVID-19
中國疾病預防控制中心
中國疾病預防控制中心檢測試劑盒建議采用2組引物/探針。第1組靶向ORF 1ab,第2組用于確認COVID-19的N-基因。
對照組
初步的電子模擬分析表明,搭配使用 IDT N-基因陽(yáng)性對照組模板**與美國疾病預防控制中心檢測試劑盒,與使用中國疾病預防控制中心、泰國衛生部以及HKU的引物/探針組進(jìn)行類(lèi)似實(shí)驗獲得的結果相符。當然,這是基于電子模擬研究,建議用戶(hù)在自己的實(shí)驗室中對所選試劑盒進(jìn)行驗證。